Военные суды насчитывают более чем 300-летнюю историю, отсчет которой следует вести с 27 января 1702 года, когда император Петр I, реализуя грандиозную реформу по созданию в России регулярной армии и флота, утвердил Военно-уголовный устав "Уложение или право воинского поведения генералов, средних и младших чи-нов и рядов солдат", изданное фельдмаршалом Б. Шереметевым.
Первый постоянно действующий гарнизонный суд (Московский) был образован Указом Петра в 1723 году для рассмотрения, преимущественно, дел о лицах, уклонявшихся от военной службы, задержанных в Москве. Именно с этой даты принято считать военные суды самостоятельным коллегиальным органом, рассматривающим дела о преступлениях военнослужащих.
В ходе военно-судебной реформы 1867 года при императоре Александре II вопрос о военных судах, их подсудности и принципах деятельности получил нормативное регулирование. При этом в основание реформы были положены коренные начала судебных уставов: состязательность, равноправие сторон, устность и гласность. Коренной перелом, произошедший в истории нашего государства в 1917 году, привел к упразднению всех действовавших ранее государственных органов, в том числе и судебных. Не избежали этой участи и военные суды. Однако вскоре новое руководство страны признало важность возрождения базовых государственных институтов, без которых немыслимо существование государства как такового. Необходимость обеспечения судебной деятельности в армии, особенно в условиях гражданской войны и отражения иностранной интервенции, требовала создания особых судебных органов.
В 1918 году начался новый этап в развитии военно-судебной системы России - период деятельности военных трибуналов. Первый военный трибунал был создан в июле 1918 года Реввоенсоветом 1-ой армии Восточного фронта, а к концу 1918 года революционные военные трибуналы были учреждены при всех фронтах и действующих армиях. Для руководства всей деятельностью военных трибуналов приказом № 94 Реввоенсовета Республики от 14 октября 1918 года был образован революционный военный трибунал Республики, который приступил к работе - провел первое судебное заседание - 8 декабря 1918 года. Именно эта дата и вошла в историю военных трибуналов Советской Армии и Флота как начало их организованной деятельности.
На различных этапах развития нашего государства менялось политическое руководство страны, а также направления внутренней и внешней политики, однако военные суды никогда не утрачивали своей значимости, выполняя задачи по поддержанию законности и правопорядка в Вооруженных Силах. После распада Советского Союза, система военных судов стала частью судебной системы Российской Федерации. Военные суды стали федеральными судами общей юрисдикции, осуществляющими судебную власть в Вооруженных Силах Российской Федерации. В настоящее время система насчитывает более 100 судов, расположенных не только на территории России, но и за ее пределами.
В соответствии с Федеральным Конституционным законом "О военных судах Российской Федерации", регламентирующим полномочия, порядок образования и деятельности военных судов, к компетенции военных судов отнесены:
1) гражданские и административные дела о защите нарушенных и (или) оспариваемых прав, свобод и охраняемых законом интересов военнослужащих Вооруженных Сил Российской Федерации, других войск, воинских формирований и органов, граждан, проходящих военные сборы, от действий (бездействия) органов военного управления, воинских должностных лиц и принятых ими решений;
2) дела о всех преступлениях, совершенных военнослужащими и гражданами, проходящими военные сборы, дела о преступлениях, совершенных гражданами (иностранными гражданами) в период прохождения ими военной службы, военных сборов, а также дела, отнесенные к компетенции военных судов Уголовно-процессуальным кодексом Российской Федерации;
3) дела об административных правонарушениях, совершенных военнослужащими, гражданами, проходящими военные сборы;
4) дела по заявлениям о присуждении компенсации за нарушение права на судопроизводство в разумный срок или права на исполнение судебного акта в разумный срок по делам, подсудным военным судам.
Кроме того, военным судам подсудны гражданские дела по искам командиров войсковых частей о привлечении военнослужащих к материальной ответственности. В 1993 году на военные суды была возложена функция по разрешению гражданско-правовых споров между военнослужащими и воинскими должностными лицами (органами военного управления), которая в течение последующих лет по объему судебной работы начинает занимать доминирующее место в деятельности военных судов.
Если дела о преступлениях, совершенных группой лиц, группой лиц по предварительному сговору, организованной группой или преступным сообществом, подсудны военному суду в отношении хотя бы одного из соучастников, а выделение уголовного дела в отношении остальных лиц невозможно, указанные дела в отношении всех лиц рассматриваются соответствующим военным судом.
Военные суды в случаях и порядке, которые установлены федеральным законом, рассматривают материалы о совершении военнослужащими, гражданами, проходящими военные сборы, грубых дисциплинарных проступков, за совершение которых может быть назначен дисциплинарный арест.